Waldviertler Whisky J.H. wird in Fässern aus Manhartsberger Sommereiche oder Traubeneiche gelagert. Sie gibt dem Whisky einen milden Vanilleton.

Die Fässer werden 3 mal befüllt. 
 
Lagerzeiten:

• Eine Erstbefüllung in neuen Fässern lagert mind. 3-4 Jahre
• Eine Zweitbefüllung lagert in den gleichen Fässern 5-6 Jahre
• Um die Fässer ein drittes Mal mit Whisky befüllen zu können, müssen sie vorher zerlegt, ausgehobelt und neu ausgebrannt werden; die Lagerung dauert 8 bis 12 Jahre, der Whisky kann aber auch bis zu 18 Jahre gelagert werden.

Bevor der Whisky in die Flasche kommt wird er mit Urgesteinwasser auf Trinkstärke
(41 %Vol.) verdünnt. Dannach reift er in einem Zwischenlager nach, damit sich Urgesteinwasser und Whisky "verbeissen" oder "verheiraten" können. Anschließend wird er filtriert und in Flaschen gefüllt. 

Für Whisky-Kenner und Liebhaber werden auch Jahrgangsabfüllungen in Fassstärken (50 bis 60 Vol %) und ausgewählte Abfüllungen oder Selectionen (46 %)  angeboten.  

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